Miniconda是Anaconda的基础版，提供环境管理
下载
Miniconda官网
使用最新包的地址下载
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$ wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
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下载完成：
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$ ls
Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
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安装
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$ sh Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
Welcome to Miniconda3 py39_4.10.3
In order to continue the installation process, please review the license
agreement.
Please, press ENTER to continue
>>>
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回车继续，然后按空格直接跳到文档底部，输入yes并回车
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Do you accept the license terms? [yes|no]
[no] >>>yes
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Miniconda3 will now be installed into this location:
/home/xxx/miniconda3
- Press ENTER to confirm the location
- Press CTRL-C to abort the installation
- Or specify a different location below
[/home/xxx/miniconda3] >>>
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之后一路yes回车即可
添加国内源
conda默认从国外服务器上下载包，速度较慢，可换为国内源
清华源
创建新环境
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conda create -n rnaseq python==3.7 -y
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测试python3.7对各种包的支持较好
完成后，进入该环境
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$ conda activate rnaseq
(rnaseq) xxx@luo-lab-tower:~$
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命令提示符前的括号表示当前的环境，只有进入到该环境中才可以使用该环境中的包，可以创建多个环境，多个环境之间互不影响。
安装hisat2-stringtie分析流程所需的软件包
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(rnaseq) xxx@luo-lab-tower:~$ conda install fastqc -y
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fastqc 用于检验reads读数质量
用相同办法继续安装：
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hisat2
samtools
stringtie
htseq-count
tqdm
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参照该博文安装sratoolkit最新版
官方安装包地址：https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/
最新的应该是2.11.0
技巧
完成以上后，自行google了解这些包的主要用途和基本使用方法。